Based on

TV-series zoals 武装錬金 (2006)

Het verhaal begint wanneer middelbare scholier Kazuki Muto op een nacht wordt vermoord door een mysterieus meisje te redden van een monster, maar hij wordt wakker in zijn studentenhuis en denkt dat het een droom is geweest; Hij komt er echter al snel achter dat de droom helemaal geen droom was wanneer een gigantisch slangachtig monster hem en zijn zus aanvalt. Tokiko Tsumura, het meisje dat hij heeft gered, legt uit dat het monster een homunculus is. Kazuki was erdoor aangevallen en gedood toen hij haar aan het redden was; Ze voelde zich echter verantwoordelijk voor hem en bracht hem weer tot leven door een Kakugane-medaillon in zijn borst te plaatsen, dat als vervangend hart diende.